Caracterización de la diversidad genética del cerdo criollo venezolano presente en los Edos. Apure, Barinas y Guárico, utilizando marcadores microsatélites

Abstract

Con el objetivo de caracterizar la diversidad genética del cerdo Criollo venezolano presente en los estados Apure, Barinas y Guárico, utilizando marcadores microsatélites, se analizaron muestras de ADN de folículos pilosos o sangre de 22 individuos de Masaguaral, 26 El Socorro, 31 Guayabal, 31 Arismendi, 29 Capanaparo, 32 Cunaviche, 29 alentejanos, 30 ibéricos, 21 Landrace y 14 Large White. Se analizaron en el Laboratorio de Genética Molecular del Centro de Investigaciones en Biotecnología Agrícola en el Instituto de Genética de la Facultad de Agronomía de la Universidad Central de Venezuela. Se amplificaron 14 marcadores microsatélites por la técnica de PCR y se tipificaron los fragmentos mediante tinción con plata. Se calculó el número de alelos, frecuencias alélicas, contenido de información polimórfica, las heterocigosidades, equilibrio Hardy – Weinberg, probabilidad de exclusión, distancias genéticas, árboles filogenéticos, estadísticos “F”, índice de Nei y análisis de la estructura de las poblaciones. El número de alelos por locus se ubicó entre 3,31 (alentejano) y 4,15 (Masaguaral) para un total de 63 alelos. Con excepción del marcador SW122 los demás loci resultaron polimórficos. Los alelos 155, 165 y 171 (S0225) están privados en la raza Landrace; el alelo 240 (S0227) está privado en la población de Arismendi; mientras que el alelo 219 está solo en los cerdos Criollos venezolanos. Las heterocigosidades y el índice de contenido polimórfico se ubicaron en el rango de 0,408 – 0,609, siendo la heterocigosidad esperada generalmente superior a la observada. Dentro de las poblaciones los marcadores en desequilibrio variaron entre dos (Masaguaral y Guayabal) y siete (Large White). La probabilidad de exclusión por población usando un panel de 10 marcadores se ubicó en valores superiores al 99%. Se observó moderada diferenciación genética (FST = 12,5%; GST = 13,6%) y un ligero aumento de homocigosis en algunas poblaciones (FIS = 0,034 – 0,167). Las distancias genéticas revelaron que los grupos más cercanos son El Socorro y Arismendi y estos a su vez muy cercanos a las razas comerciales. Los cerdos de Capanaparo y Guayabal se separan en un grupo distinto; mientras que los cerdos de Cunaviche se aproximan a los cerdos de la Península Ibérica. El análisis de agrupamiento utilizando las distintas metodologías corroboró la agrupación descrita, considerándose al final la existencia de seis clúster bien diferenciados. Se concluye que existe variabilidad genética dentro y entre los cerdos Criollos venezolanos y representan grupos definidos que justifican aplicar planes de conservación, multiplicación y mejora genética.